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Esta colección está compuesta por libros cuyas temáticas son arqueología, antropología, etnología, sociología , historia, historia colonia, y áreas afines a las Ciencias Sociales.
Colección General
Conjunto de libros que cubren una amplia gama de temas y áreas del conocimiento, destinados a la consulta y préstamo por parte de los usuarios. En el caso de la Biblioteca Especializada las áreas temáticas que se manejan son Antropología, Arqueología e Historia colonial, además todas las temáticas de las ciencias sociales y afines, como etnología, patrimonio cultural y arqueológico, entre otros.
Informes arqueológicos
Se encuentra conformada por los informes finales resultantes del proceso de licenciamiento arqueológico, que suman más de 7,000 documentos disponibles tanto en formato físico como digital.
Documentos de Investigación
Compuesta por una serie de documentos misionales, tésis, manuscritos, realizados por funcionarios, contratistas e investigadores que hicieron parte del ICANH.
Fototeca
Reúne la historia gráfica del instituto a través de su historia, compuesta por más de 20.000 fotografías.
Videoteca
Enfocada a los ejes de investigación del instituto, compuesta por 452 ejemplares.
Fonoteca
Colección sonora que recoge eventos institucionales, eventos culturales investigaciones, programas de radio, entre otros; compuesta por 530 ejemplares.
Microfilms
Documentos copiados de algunos documentos de fondos pertenecientes de los Archivos General de Indias e Histórico de Madrid, son más de 550 ejemplares.
Cartografía
Material cartográfico de Colombia, con énfasis en la misionalidad del instituto, compuesta por aproximadamente 1000 ejemplares.
Hemeroteca
Colección compuesta por revistas científicas del sello editorial del ICANH y otras instituciones nacionales y del exterior, enfocadas en las temáticas afines al Instituto.