El área contable del ICANH, es la encargada de registrar, controlar, presentar la información financiera, económica, patrimonial y presupuestal de la entidad, mediante la consolidación de los Estados Financieros, los cuales sirven como herramienta para la adecuada toma de decisiones, garantizar la transparencia, el adecuado manejo de los recursos en la entidad y la rendición de cuentas a la ciudadanía. La contabilidad de la organización, está sujeta a las normas y conceptos emitidos por la Contaduría General de la Nación quien es la máxima autoridad en el País en materia Contable.